Az életmű kiemelkedően alapos feldolgozottságára való tekintettel e helyt csupán Pilinszky János önálló, magyar nyelvű köteteinek felsorolására szorítkozunk.
Önálló, magyar nyelvű kötetei
1946
- 1. Trapéz és korlát. Versek. Bp. 1946. Ezüstkor, 39 p. – Ua. [Reprint kiadása, Jelenits István utószavával: Székesfehérvár, 1993. Vörösmarty Megyei Könyvtár, 46 p.]
1957
1959
1964
1970
- 5. Nagyvárosi ikonok. Összegyűjtött versek 1940–1970. A költő portréját Kondor Béla rajzolta. Bp. 1970. Szépirodalmi Könyvkiadó, 171 p., 1 t. – 2., jav. kiad.: uo., 1971. [3.] kiad. Bratislava–Bp. 1971. Madách Kiadó–Szépirodalmi Könyvkiadó, 173 p., 1 t.
1972
- 6. Szálkák. Versek. Bp. 1972. Szépirodalmi Könyvkiadó, 80 p. – 2. kiad.: uo., 1975. 2. kiadás. Bp. 1975. Szépirodalmi Könyvkiadó, 81 p.
1974
7. Végkifejlet. Versek és színművek. Borítóterv Alexander Czjzek. Bp. 1974. Szépirodalmi Könyvkiadó, 123 p.
- 8. A nap születése. [Verses mesék] Bálint Endre rajzaival. Bp. 1974. Móra, 91 p. = 2. kiad.: uo., 1985.
1975
- 9. Tér és kapcsolat. Schaár Erzsébet szoborillusztrációival. A fényképeket Balla Demeter, Gulyás János, Kovács Ferenc készítette. A könyvet Erdélyi János tervezte. Bp. 1975. Magvető, [36] lev.
1976
- 10. Kráter. Összegyűjtött és új versek. Balla Demeter fotójával. Bp. 1976. Szépirodalmi Könyvkiadó, 226 p., 1 t. = 2.kiad.: uo., 1981.
1977
- 11. Beszélgetések Sheryl Suttonnal. Egy párbeszéd regénye. Wiener Pál fotóival. Bp. 1977. Szépirodalmi Könyvkiadó, 105 p., 3 t. = 2., bőv. kiad. Budapest. 2020. Magvető, 208 p.
1978
- 12. Válogatott művei. [Versek, tanulmányok és színművek.] Balla Demeter fotójával. Bp. 1978. Magvető–Szépirodalmi Könyvkiadó, 221 p. (Harminc év)
1981
- 13. Apokrif. [Versek.] Vál. Domokos Mátyás. Békéscsaba, 1981. Megyei Könyvtár, Házi ny., [Japán technikával] 14. lev. – 29 cm. (Poesis Hungarica 2.)
1982
- 14. Szög és olaj. Próza. [Válogatott publicisztikai írások.] Szerk. Jelenits István. A fedőlap fotóját Balla Demeter készítette. Bp. 1982. Vigilia, 513 p. (Vigilia-könyvek)
1983
- 15. Beszélgetések Pilinszky Jánossal. Vál. és szerk. Török Endre. Utószó Reisinger János. A védőborító Balla Demeter, az előzék Törőcsik Juli fotójának felhasználásával készült. Bp. 1983. Magvető, 255 p.
- 16. Pilinszky János legszebb versei. Vál., bev. Adonyi Nagy Mária. Bukarest, 1983. Albatrosz, 188 p.
1984
- 17. A mélypont ünnepélye. Próza.1–2. köt. [Válogatott publicisztikai és szépprózai írások.] A vál., szerk., sajtó alá rend., az előszó és utószó Jelenits István munkája. Külső borítón fakszimilék] Bp. 1984. Szépirodalmi Könyvkiadó, 539; 234 p.
1985
- 18. A nap születése. [Verses mesék] Bálint Endre rajzaival. 2. kiad. Bp. 1985. Móra, 91 p. = 1. kiad. uo, 1974.
1987
- 19. Pilinszky János összegyűjtött versei. A szerk., sajtó alá rend. és az utószó Jelenits István munkája. Bp. 1987. Szépirodalmi Könyvkiadó, 253 p.
1988
- 20. Kalandozás a tükörben. [Az azonos című mese prózaváltozata] Irsa Katalin illusztrációival. Bp. 1988. Móra, 22 p.
1992
- 21. Pilinszky János összegyűjtött versei. Szerkesztette, a szöveget gondozta és az utószót írta Jelenits István. A fedél Balla Demeter és Törőcsik Juli fotójának felhasználásával készült. Bp. 1992. Századvég–2000 Könyvek, 281 p. (Pilinszky János összegyűjtött művei.) – További kiadások: Bp. 1993.; 1995. Századvég
1993
- 22. Trapéz és korlát. Versek. Az 1946-os kötet reprint kiadása, Jelenits István utószavával. Székesfehérvár, 1993. Vörösmarty Megyei Könyvtár, 46 p.
- 23. Széppróza. Szerkesztette, a szöveget gondozta, a mutatókat készítette és az utószót írta Hafner Zoltán. A fedél Balla Demeter és Törőcsik Juli fotójának felhasználásával készült. Bp. 1993. Századvég, 252 p. (Pilinszky János összegyűjtött művei.) = 2., jav., bőv. kiad. Bp. 1996. Osiris, 272 p. (Osiris klasszikusok) = ua. 1998. = 3., jav. kiad. A címlap Lugosi István fényképének (1969) felhasználásával készült. Bp. 2004. Osiris, 263 p. (Osiris klasszikusok.) = ua. Bp. 2015. Magvető, 336 p.
- 24. Tanulmányok, esszék, cikkek. 1–2. köt. Szerkesztette, a szöveget gondozta, a mutatókat készítette és az utószót írta Hafner Zoltán. A fedél Balla Demeter és Törőcsik Juli fotójának felhasználásával készült. Bp. 1993. Századvég, 419; 374 p. (Pilinszky János összegyűjtött művei.)
1994
- 25. Beszélgetések. Szerkesztette, a szöveget gondozta, a mutatókat és a jegyzeteket készítette, az utószót írta Hafner Zoltán. A fedél Balla Demeter és Törőcsik Juli fotójának felhasználásával készült. Bp. 1994. Századvég, 303 p. (Pilinszky János összegyűjtött művei.)
- 26. Simone Weil: Kegyelem és nehézkedés. Pilinszky János fordításai. Szerk. és az utószót írta Hafner Zoltán. A szöveget gondozta és a jegyz. összeáll. Bende József és Hafner Zoltán. Bp. 1994. Vigilia, 177 p. (XX. Századi Keresztény Gondolkodók 6.)
1995
- 27. Naplók, töredékek. Szerkesztette, a szöveget gondozta, a jegyzeteket és a mutatókat készítette, az utószót írta Hafner Zoltán. A fedél Balla Demeter és Törőcsik Juli fotójának felhasználásával készült. Bp. 1995. Osiris, 285 p. (Pilinszky János összegyűjtött művei.)
- 28. Pilinszky fényképei. Szerkesztette Hafner Zoltán, Herner János, Kucsera András. Jegyzetek, utószó Hafner Zoltán. A borítón Szebeni András felvétele; a hátsó borítón Klösz György felvétele Bp. 1995. Pesti Szalon, n p.
1996
- 29. Széppróza. 2., jav., bőv. kiadás. Szerkesztett, a szöveget gondozta, a jegyzeteket és a mutatókat készítette, és az utószót írta Hafner Zoltán. A borító Moldvay József portréjának felhasználásával készült. Bp. 1996. Osiris, 272 p. (Osiris klasszikusok.) = 1. kiad. Bp. 1993. Századvég, 252 p. (Pilinszky János összegyűjtött művei.) = 3. jav. kiad. A címlap Lugosi István fényképének (1969) felhasználásával készült. Bp. 2004. Osiris, 264 p. = ua. Bp. 2015. Magvető, 336 p.
- 30. Pilinszky János összes versei. Szerkesztette, a szöveget gondozta és az utószót írta Hafner Zoltán. A borító Moldvay József portréjának felhasználásával készült. Bp. 1996. Osiris, 341 p. (Osiris klasszikusok.) = ua. 1997. = 2., jav., bőv. kiad. Bp. 1998. Osiris, 350 p. (Osiris klasszikusok.) = ua. 1999. = ua. A borítót Unipan Helga tervezte. Kolozsvár–Bp. 1997. Polis Könyvkiadó–Osiris, 338 p. = 3., jav. kiad. A Rembrandt c. vers és a [Bajvívás volt itt…] kezdetű verstöredék elhagyásával. Bp. 2001. Osiris, 350 p. (Osiris klasszikusok.) = 4., jav. kiad. Bp., 2002. Osiris, 350 p. (Osiris klasszikusok) = 5. bőv. kiad. A kötet az előző kiadáshoz képest a Fabula, az Alkohol (2) és a Jézus a keresztfán c. versekkel, valamint a [Mi mindíg itt volt…] kezdetű töredékkel bővül. Bp., 2003. Osiris, 352 p. (Osiris Klasszikusok) = uaz. 2006. Bp. Osiris, 352 p. (Osiris Klasszikusok) = 2015. Bp. Magvető, 379 p.
- 31. Versfüzet. [1948. Fakszimile] Utószó Hafner Zoltán. A borítón Pilinszky kézírása, ill. Pilinszky János és Takács Vilmos, az 1940-es évek elején. A fotó készítője ismeretlen. Bp. 1996. Kortárs. = 2. kiad. uo., 1997.
- 32. A rózsafüzér titkairól. Simon András grafikáival. Bp. 1996. Új Ember, 39 p. (Új Ember füzetek 5.)
1997
- 33. Pilinszky Rómában. 1947. 1967. Levelek, esszék, fényképek. A szerkesztés, a szöveggondozás és a jegyzetek Hafner Zoltán munkája. A borítón Pilinszky János kézírása, ill. fotója (Róma, 1967). Bp. 1997. Kortárs, 91 p.
- 34. Pilinszky János összegyűjtött levelei. Szerkesztette, a szöveget gondozta, a jegyzeteket és a mutatókat készítette, az utószót írta Hafner Zoltán. A borító Moldvay József portréjának felhasználásával készült. Bp. 1997. Osiris, 723 p. (Osiris klasszikusok.)
- 35. Pilinszky [Képeskönyv.] Szerk. Hafner Zoltán. Bp. 1997. Osiris, p. n. — „A kötet a P. J. életművét bemutató CD-ROM mellékleteként jelent meg, 1997 karácsonyára.”
1999
- 36. Publicisztikai írások. Szerk., a szöveget gondozta, a jegyzeteket és a mutatókat készítette, az utószót írta Hafner Zoltán. Bp. 1999. Osiris, 975 p. (Osiris Klasszikusok)
2001
- 37. Pilinszky János Márkus Annának. Kézirat. [Hasonmás.] Utószó Domokos Mátyás. Bp. 2001. Nap Kiadó. [96 l.] sztl.
- 38. Ottlik Géza: Csillagszórók az éjszakák.– Pilinszky János: A test költészete. Versek a Rádióból. Összeáll. és az utószót írta Hafner Zoltán. Bp. 2001. Palatinus, 57 l.
2003
- 39. Válogatott versek. Válogatta és a jegyzeteket készítette Hafner Zoltán. Bp. 2003. Osiris, 136 p. (Osiris Diákkönyvtár) = További kiadás: uo., 2006.
2007
2008
- 42. Tandori Dezső – Pilinszky János: A semmi napja mielőtt. Tandori Dezső rajzai Pilinszky János verseihez. Bp. 2008. Kortárs Kiadó, 76 p.
2009
2011
44. Stigma. Válogatott versek. Vál. és szerk.: Rónay László. Utószó: Szabó Ferenc SJ. Bp. 2011. Éghajlat Kiadó, 105 p.
- 45. Keresztről keresztre. [Esszék] Vál., szerk., szöveggond., utószó, jegyzetek, névmutató: Hafner Zoltán. Bp. 2011. Vigilia, 185 p.
2013
- 46. Csönd és közelség. Pilinszky János füveskönyve. Vál., szerk., utószó, jegyzetek: Reisinger János. Szeged, 2013. Lazi, 169 p.
2015
- 47. Pilinszky János összes versei. Szerk., szöveggond., utószó: Hafner Zoltán. Bp. 2015. Magvető, 379 p. – A kötet az előző kiadáshoz (2003) képest három töredékkel ([Az égi luszter besötétül…], [Ítélet. De milyen ítélet?], [Vallomás]), egy versfordítással (Ivan Skála: Kié a tavasz) és a Kivégzés c. vers P. J. által készített fordításával bővült. További kiadások: uo., 2016., 2018.
2016
- 49. Beszélgetések. Szerk., szöveggond., jegyzetek, mutatók, utószó: Hafner Zoltán. Bp. 2016. Magvető, 475 p.
2019
2020
- 51. Beszélgetések Sheryl Suttonnal. Egy párbeszéd regénye. Jav., bőv. kiad. Szerk. Bende József. Bp. 2020. Magvető, 203 l.
2021
52. Önéletrajzaim. Szöveggond., utószó, jegyzetek: Bende József. Bp. 2021. Magvető, 139 p.
A költő munkásságának részletes bibliográfiáját lásd: Bende József – Hafner Zoltán: Pilinszky János bibliográfia. Bp. 2001. Osiris, 427 p.; Hafner Zoltán: Pilinszky János-bibliográfia (2001–2015) = Leírás és értelmezés. Újholdas szerzők a hagyománnyá válás közben. Bp. 2016. Ráció, 327–436.; továbbá a Digitális Irodalmi Akadémia Pilinszky-aloldalának bibliográfia menüpontjában.