1931 szeptemberében beiratkozik a budapesti Piarista Gimnáziumba. A középiskola mind a nyolc osztályát itt végzi. A vakációkat a Balaton mellett, Kenesén tölti, családi nyaralójukban. Felsős korában gyakran szerepel – főként szavalattal – az iskola önképzőkörében.
1937 nyarán meghal édesapja, id. Pilinszky János.
1938 májusában megjelenik első verse (Anyám) az Életben.
1939 februárjában a Vigilia közli Üzenet az üvegvárból című versét. (A lapnak haláláig szerzője marad.)
1939 júniusában érettségi vizsgát tesz. Ősszel beiratkozik a Pázmány Péter Tudományegyetem Jog- és Államtudományi Karára. Mindössze fél évet hallgat itt.